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羧基四甲基罗丹明-亚磷酰胺TAMRA Phosphoramidite的分子结构

  注:以下所介绍产品仅用于科研,来自西安齐岳生物小编wyh,咱们咱们能够供给相关产品的定制服务产品名称:羧基四甲基罗丹明-亚磷酰胺,TAMRA Phosphoramidite的分子结构与化学组成TAMRA荧光团:分子式C₄₀H₅₀N₅O₆P,分子量727.83,属罗丹明衍生物,含共轭芳香环体系,激起波长546-555 nm,发射波长576-580 nm(橙红色荧光),量子产率高,光安稳性杰出,适配FRET、qPCR等运用。亚磷酰胺基团:作为核酸组成的活性中间体,经过3′-亚磷酰胺键与寡核苷酸链的5′-羟基反响,构成安稳磷酸二酯键,支撑固相自动化组成(如DNA/RNA组成仪)。羧基润饰:5-羧基位点供给生物偶联活性,可经过酰胺化反响与氨基(如蛋白质、肽链)结合,完成靶向符号。固相组成途径:选用亚磷酰胺法,经过四步循环(脱维护、缩合、带帽、氧化)在固相载体(如CPG)上延伸核苷酸链。TAMRA-亚磷酰胺作为荧光符号单体,在组成过程中直接引进寡核苷酸(引物、探针、适配体)的5′端或内部,构成荧光符号产品。偶联功率:亚磷酰胺与羟基在活化剂(如四唑)效果下快速反响,需操控温度(0-4℃)及pH(中性至弱碱性),防止副反响。脱维护与氧化:运用三氯乙酸脱除5′-羟基维护基(DMT),碘氧化安稳磷酸三酯键;强碱(如浓氨水)或许会引起罗丹明降解,需优化脱维护条件(如t-丁胺/水混合液,60℃处理6-12小时)。纯化与表征:经过HPLC、离子交换层析或PAGE纯化,质谱(MS)、核磁共振(NMR)验证结构,纯度≥95%。荧光特性:高荧光强度、杰出的光安稳性及光谱兼容性(适配FAM、Cy3等染料),适用于多重符号试验。溶解性与安稳性:溶于乙腈、DMF、DMSO等有机溶剂,水溶液需避光保存;固态粉末-20℃枯燥避光贮存,溶液分装-80℃冷冻,防止重复冻融及高温(>40℃)、强氧化剂或极点pH。反响活性:亚磷酰胺基团易水解,需惰性气体维护;羧基可经过活化(如NHS酯)与氨基构成安稳酰胺键,支撑蛋白质、核酸偶联。

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